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Traitement automatique de la langue biomédicale au LIMSI (Biomedical language processing at LIMSI)

Christopher R. Norman, Cyril Grouin, Thomas Lavergne, Aurélie Névéol, Pierre Zweigenbaum
2017 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
Nous proposons des démonstrations de trois outils développés par le LIMSI en traitement automatique des langues appliqué au domaine biomédical : la détection de concepts médicaux dans des textes courts  ...  , la catégorisation d'articles scientifiques pour l'assistance à l'écriture de revues systématiques, et l'anonymisation de textes cliniques.  ...  littérature dans seize sous-domaines de l'informatique biomédicale.  ... 
dblp:conf/taln/NormanGLNZ17 fatcat:wy2dk2of2jh25ptdimls4uvaze

A Named Entity recognizer for French (Un reconnaisseur d'entités nommées du Français) [in French]

Yoann Dupont, Isabelle Tellier
2014 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
Nous proposons une démonstration d'un reconnaisseur d'entités nommées du Français appris automatiquement sur le French TreeBank annoté en entités nommées.  ...  Pour télécharger la branche du programme, il faut entrer la commande suivante dans un terminal 2 : Le programme peut enchaîner divers traitements les uns à la suite des autres, comme effectuer un étiquetage  ...  & Erik F. & De Meulder, 2003) ou encore NLPBA (KIM et al., 2004) pour les entités biomédicales.  ... 
dblp:conf/taln/DupontT14 fatcat:4md4skzeonf73dugdosmslkfqa

Extraction de relations temporelles dans des dossiers électroniques patient (Extracting Temporal Relations from Electronic Health Records)

Julien Tourille, Olivier Ferret, Aurélie Névéol, Xavier Tannier
2016 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
Les performances obtenues sont comparables dans les deux langues, suggérant ainsi que différents domaines cliniques et différentes langues pourraient être abordés de manière similaire.  ...  Nous présentons des modèles de classification supervisée pour l'extraction de des relations en français et en anglais.  ...  Remerciements Nous remercions le Service d'Informatique Biomédicale (SIBM) ainsi que l'équipe CISMeF du CHU de Rouen pour la mise à disposition du corpus LERUDI.  ... 
dblp:conf/taln/TourilleFNT16 fatcat:f64jqdbl3rerronc37bldcwiuu

Traitement De La Langue Biomédicale Au Limsi

Christopher Norman, Cyril Grouin, Thomas Lavergne, Aurélie Névéol, Pierre Zweigenbaum
2017 Zenodo  
processing tools developed at LIMSI for applications in the biomedical domain : medical concept detection in short texts, scientific paper categorization to assist systematic review authors, clinical text de-identification  ...  littérature dans seize sous-domaines de l'informatique biomédicale.  ...  Nous présentons un système de classification automatique d'articles présélectionnés à l'aide d'une requête soumise à un moteur de recherche (Norman et al., 2017) .  ... 
doi:10.5281/zenodo.887627 fatcat:po53vmeauzep5c64ru73f3ausy

Profilage sémantique endogène des relations de synonymie au sein de Gene Ontology

Thierry Hamon, Natalia Grabar
2009 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
Les synonymes acquis sont ensuite profilés grâce aux indicateurs endogènes inférés automatiquement à partir de ces mêmes terminologies (d'autres types de relations, inclusions lexicales, productivité,  ...  Le calcul de la similarité sémantique entre les termes repose sur l'existence et l'utilisation de ressources sémantiques.  ...  Par ailleurs, WordNet est insuffisant pour le traitement de la langue biomédicale (Bodenreider et al., 2003) et l'initiative de son adaptation à ce domaine (Smith & Fellbaum, 2004) semble avoir été  ... 
dblp:conf/taln/HamonG09 fatcat:wnumt5supfe6nfrirh3siz2iba

Identification de profil clinique du patient: Une approche de classification de séquences utilisant des modèles de langage français contextualisés (Identification of patient clinical profiles : A sequence classification approach using contextualised French language models )

Aidan Mannion, Thierry Chevalier, Didier Schwab, Lorraine Goeuriot
2021 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
À partir d'une base de référence d'un modèle constitué pour la compréhension générale de la langue française, nous utilisons des modèles pré-entraînés avec masked language modelling et affinés à la tâche  ...  Ce travail étudie des approches de classification de texte utilisant des plongements de mots contextualisés en français.  ...  automatique.  ... 
dblp:conf/taln/MannionCSG21 fatcat:ym7arbxc3bdjxcbwlhvy7tulri

Morphologie contrastive au travers des domaines de spécialité et des registres

Natalia Grabar, Jolanta Chmielik
2012 SHS Web of Conferences  
Pour ce faire, nous exploitons plusieurs outils du Traitement Automatique des Langues qui nous permettent ainsi d'accéder au niveau morphologique des mots des documents et de nous concentrer de cette manière  ...  Dans ce travail, nous montrons qu'il est possible d'exploiter les informations morphologiques des documents de santé afin d'effectuer une distinction automatique efficace (avec des performances souvent  ...  ., 2005) et contient des mots de la langue générale et de la langue biomédicale. Étiquetage morpho-syntaxique.  ... 
doi:10.1051/shsconf/20120100305 fatcat:tj6bpcpqbremrcdeicpteehuba

Converting dependencies for syntactic analysis of French into PASSAGE functional relations (Convertir des analyses syntaxiques en dépendances vers les relations fonctionnelles PASSAGE) [in French]

Patrick Paroubek, Munshi Asadullah, Anne Vilnat
2013 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
dépendances de surface pour l'analyseur syntaxique Bonsai, et d'autre part le formalisme d'annotation PASSAGE développé initialement pour servir de support à des campagnes d'évaluation ouvertes en mode  ...  l'établissement d'une passerelle bidirectionnelle entre d'une, part les schémas d'annotation syntaxique en dépendances qui ont été définis pour convertir les annotations du French Treebank en arbres de  ...  (PTB) et des textes de la littérature biomédicale académique, en utilisant des convertisseurs entre SD, GR, un analyseur syntaxique profond (une implémentation de HPSG (Miyao et al., 2004) Dep-FTB  ... 
dblp:conf/taln/ParoubekAV13 fatcat:binevduiwveyhbjwrxhvl6ryba

Détection automatique de phrases en domaine de spécialité en français (Sentence boundary detection for specialized domains in French )

Arthur Boyer, Aurélie Névéol
2018 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
aval dans une chaîne de traitement automatique s'appuyant sur des textes découpés en phrases.  ...  La detection de frontières de phrase à l'aide d'un modèle OpenNLP entraîné sur un corpus clinique offre une F-mesure de .73, contre .66 pour la version standard de l'outil.  ...  Ce travail a bénéficié d'une aide de l'Agence Nationale de la Recherche portant la référence CABeRneT ANR-13-JS02-0009-01. Références  ... 
dblp:conf/taln/BoyerN18 fatcat:ky2owvlwi5eclbhgcdaufr7ovy

Évaluation de l'indexation des comptes rendus médicaux à l'aide d'un outil états-unien adapté pour le français [chapter]

Saoussen Sakji, Peter Elkin, Stéfan J. Darmoni
2011 Informatique et Santé  
Remerciements Les auteurs remercient tous les membres de l'équipe états-unienne du Professeur Peter Elkin qui ont participé à la réalisation de cette étude.  ...  autres sources de connaissances biomédicales [6] .  ...  ) et l'extraction et l'indexation automatique des documents ont fait évoluer le traitement de l'information et des connaissances.  ... 
doi:10.1007/978-2-8178-0285-5_14 fatcat:qogi6jkmkzh5ni3iwqtosrofyi

Grouping of terms based on linguistic and semantic regularities in a cross-lingual context (Groupement de termes basé sur des régularités linguistiques et sémantiques dans un contexte cross-langue) [in French]

Marie Dupuch, Thierry Hamon, Natalia Grabar
2013 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
Nous proposons d'exploiter des méthodes du Traitement Automatique de Langues dédiées à la structuration de terminologie indépendamment dans deux langues (anglais et français) et de fusionner ensuite les  ...  L'union des résultats obtenus dans les deux langues améliore la qualité globale des clusters.  ...  De plus, ces régularités peuvent être renforcées dans un contexte cross-langue. Ce point peut être intéressant pour différentes applications du Traitement Automatique de Langues (TAL).  ... 
dblp:conf/taln/DupuchHG13 fatcat:szvhjfniqjasxn437ige54swxq

Spotting scientific and technical specialization in biomedical documents using morphological clues

Jolanta Chmielik, Natalia Grabar
2011 Revue TAL  
Lorsque les portails de santé proposent cette distinction, elle est effectuée manuellement. Nous effectuons une catégorisation automatique des pages de la Toile en fonction de leur spécialisation.  ...  Effectivement, une très grande technicité des documents empêche les patients de bien comprendre le contenu et peut avoir des conséquences négatives sur la gestion de leur maladie et la communication avec  ...  Remerciements Nous remercions Fiammetta Namer, Nabil Hathout et les relecteurs anonymes pour nous avoir aidés dans l'amélioration du contenu de notre travail et de son étendu.  ... 
dblp:journals/tal/ChmielikG11 fatcat:o54gi2pk25cafbryc5lbdsisfe

Défis et possibilités en matière de santé publique rendus possibles grâce aux progrès du traitement des langues naturelles
Challenges and opportunities for public health made possible by advances in natural language processing

Oliver Baclic, Matthew Tunis, Kelsey Young, Coraline Doan, Howard Swerdfeger
2020 Relevé des maladies transmissibles au Canada  
Traitement des langues naturelles et la maladie à coronavirus de 2019 (COVID-19) Conclusion . Searching for health.  ...  la compréhension réelle de la langue.  ... 
doi:10.14745/ccdr.v46i06a02f fatcat:k5vun62orzbddhdndsjuzei4wm

Contrôle prédictif et codage du but des actions oro-faciales (Predictice control and coding of orofacial actions) [in French]

Krystyna Grabski, Laurent Lamalle, Marc Sato
2012 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
réalisation répétée de mouvements supralaryngés (protrusion des lèvres, abaissement de la mâchoire, rétraction de la langue).  ...  de la langue (condition "langue") et une ouverture mandibulaire (condition "mâchoire").Une condition de repos (sans mouvement ni production sonore) servait de tâche de référence.Pour caractériser un possible  ... 
dblp:conf/taln/GrabskiLS12 fatcat:x2fzqydoqfdshcxvpwjmnnfegu

Analyse morphologique en terminologie biomédicale par alignement et apprentissage non-supervisé

Vincent Claveau, Ewa Kijak
2010 Traitement Automatique des Langues Naturelles & Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues  
Nous illustrons également l'intérêt de notre démarche au travers de deux applications directes de ces alignements : la traduction de termes inconnus et la découverte de relations entre morphes pour la  ...  Dans cet article, nous proposons de suivre une démarche originale mais fructueuse pour mener cette analyse morphologique sur des termes simples en français, en nous appuyant sur une langue pivot, le japonais  ...  Cet alignement se fait dans la majorité des cas à l'aide d'algorithmes 1-1, capables d'aligner un symbole (lettre ou caractère vide) de la langue source avec un symbole de la langue cible.  ... 
dblp:conf/taln/ClaveauK10 fatcat:qkwddtp4fnelbia4q4c2bluvgq
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